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量子計算助力創(chuàng)新藥物研發(fā),技術升級引領制藥業(yè)革命

  制藥業(yè)是一個與人類健康和生命息息相關的行業(yè),它也是一個不斷創(chuàng)新和進步的行業(yè)。在過去的幾十年里,制藥業(yè)經(jīng)歷了從化學合成藥、生物制品藥、基因工程藥、納米藥物等不同階段的發(fā)展,涌現(xiàn)了許多具有重大意義和影響的新型藥物,為治療各種疾病和改善人類福祉做出了巨大貢獻。同時,制藥業(yè)也面臨著從市場競爭、法規(guī)政策、社會需求等多方面的挑戰(zhàn)和壓力,需要不斷適應變化和尋求突破。其中,藥物研發(fā)是一個復雜而漫長的過程,它涉及到對分子結構、化學反應、生物活性等多方面的模擬和優(yōu)化。傳統(tǒng)的計算機在處理這些問題時,往往受到計算能力、時間和成本的限制,難以達到理想的效果。而量子計算機則可以利用其強大的并行性和精確性,對分子系統(tǒng)進行高效的模擬和搜索,從而加速藥物設計的進程,降低藥物開發(fā)的風險,提高藥物質(zhì)量和安全性。

  量子計算作為一種新興的技術領域,為制藥業(yè)帶來了新的機遇和希望,也提出了新的要求和問題。量子計算可以為制藥業(yè)提供新的思路和方法,幫助制藥企業(yè)提升研發(fā)能力,加速創(chuàng)新速度,降低開發(fā)成本,提高產(chǎn)品質(zhì)量,拓展市場空間。但是,量子計算也需要制藥企業(yè)投入更多的資源和精力,掌握更多的知識和技能,建立更好的合作和溝通,解決更多的難題和風險。

  本期二十五周年專欄中,我們關注量子計算在藥物研發(fā)中的原理、應用和前沿進展的認識和看法,以及對量子計算對制藥業(yè)未來發(fā)展的影響和啟示的思考和建議,希望提供一個全面而深入的視角,更好地了解量子計算這一革命性的新技術在藥物研發(fā)領域中的作用和價值,以及它對制藥業(yè)未來發(fā)展的挑戰(zhàn)和機遇。

  量子計算在藥物研發(fā)中的原理

  藥物研發(fā)是一個涉及到多學科交叉的領域,它需要對分子結構、化學反應、生物活性等多方面進行深入的研究和分析。其中,一個關鍵的步驟就是藥物設計,即根據(jù)目標受體或酶的結構和功能,設計出能夠與之結合并產(chǎn)生預期效果的候選藥物分子。這個過程通常包括幾個階段。

  首先是分子對接,通過計算機模擬分析候選藥物分子與目標受體或酶之間的空間構型、相互作用能量、結合模式等參數(shù),篩選出最優(yōu)化的配體。然后是分子動力學,通過計算機模擬分析候選藥物分子與目標受體或酶在不同溫度、壓力、溶劑等條件下的運動軌跡、穩(wěn)定性、可行性等參數(shù),評估其動態(tài)行為。接下來則是藥效預測,通過計算機模擬分析候選藥物分子在體內(nèi)外環(huán)境中的代謝途徑、生物利用度、毒性副作用等參數(shù),預測其藥理活性。

  每個階段都需要對大量復雜的分子系統(tǒng)進行精確而高效的模擬和搜索,這對傳統(tǒng)的計算機來說是一個巨大的挑戰(zhàn)。傳統(tǒng)的計算機使用二進制比特作為信息單元,每個比特只能表示0 或1 兩種狀態(tài)。因此,要表示一個n 位長的分子結構,就需要n 個比特。而要表示一個含有n 個原子的分子系統(tǒng),則需要2n 個比特。這意味著隨著分子系統(tǒng)規(guī)模的增加,所需的比特數(shù)將呈指數(shù)級增長,超出了傳統(tǒng)計算機的存儲和處理能力。

  而量子計算機則使用量子比特作為信息單元,每個量子比特可以同時表示0 和1 兩種狀態(tài),這就是量子疊加的特性。因此,一個量子比特可以表示兩個分子結構,n 個量子比特可以表示2n 個分子結構。這意味著量子計算機可以利用其并行性,同時處理多個分子系統(tǒng),大大提高了計算效率。此外,量子計算機還可以利用量子糾纏的特性,實現(xiàn)對分子系統(tǒng)的精確控制和測量,從而提高了計算精度。

  量子計算在藥物設計中,可以利用量子搜索算法(如Grover 算法),在指數(shù)級的候選藥物分子中快速找出最優(yōu)化的配體;也可以利用量子模擬算法(如變分量子本征求解器VQE),在多項式級的時間內(nèi)模擬分子系統(tǒng)的本征態(tài)和本征能。此外在藥效預測方面,利用量子機器學習算法(如量子神經(jīng)網(wǎng)絡QNN),可以在多項式級的時間內(nèi)學習和預測分子系統(tǒng)的藥理活性。

  在藥物研發(fā)中的應用

  量子計算在藥物研發(fā)中的應用已經(jīng)引起了全球各大制藥公司、科研機構和技術企業(yè)的廣泛關注和投入。例如,2021 年,谷歌(Google)與全球領先的研發(fā)驅(qū)動制藥公司勃林格殷格翰(Boehringer Ingelheim)達成合作協(xié)議,專注于研究和實施量子計算在藥物研發(fā)領域中的前沿用例,其中包括分子動力學模擬。新的合作關系將其在計算機輔助藥物設計、計算機建模領域的專業(yè)知識,與作為量子計算機和算法的領先開發(fā)商之一的谷歌所擁有的優(yōu)質(zhì)資源結合在了一起。

  而此前,2018 年,微軟(Microsoft)與凱斯西儲大學(Case Western Reserve University)合作,為了改善病人的護理,凱斯西儲使用微軟的量子啟發(fā)的算法,以加強其檢測癌癥腫瘤的方法。

  埃森哲(Accenture)和默克(Merck)在2018 年與亞馬遜網(wǎng)絡服務(AWS)合作,推出了一個基于云的信息學研究平臺,幫助生命科學行業(yè)的組織在藥物開發(fā)的早期階段提高生產(chǎn)力、效率和創(chuàng)新。通過為核心研究功能創(chuàng)建開放的、行業(yè)標準的應用程序編程界面,使研究人員能夠迅速采用新的功能,從而建立一個加速創(chuàng)新的生態(tài)系統(tǒng)??茖W應用提供商、內(nèi)容提供商和技術創(chuàng)新者將受益于較低的進入壁壘,新的能力更容易進入市場,幫助生命科學公司重新設想過程、用戶體驗和數(shù)據(jù)密集型研究方法。

  前沿突破

  今年初,谷歌宣布,在糾正當今量子計算機固有的錯誤方面取得了突破,其的研究結果已發(fā)表在《自然》(Nature)期刊上。研究人員表示,他們已經(jīng)找到了一種方法,可以將量子計算機處理的信息通過多個量子比特傳播,這意味著整個系統(tǒng)可以保留足夠的信息來完成計算,即使單個量子比特脫離了它們的量子態(tài)。這是一個重要的里程碑,為實現(xiàn)大規(guī)模和高質(zhì)量的量子計算奠定了基礎。

  另一方面,通過互聯(lián)網(wǎng)提供遠程訪問和使用量子計算機資源的服務,可以讓更多的用戶和開發(fā)者享受到量子計算的便利和優(yōu)勢。目前,谷歌、微軟、IBM、亞馬遜等技術巨頭都已經(jīng)推出了自己的量子云服務平臺,并與各大制藥公司、科研機構和技術企業(yè)建立了合作關系,共同探索量子計算在藥物研發(fā)領域中的應用場景和解決方案。

  量子計算對制藥業(yè)未來發(fā)展的影響和啟示

  量子計算作為一種革命性的新型計算模式,對制藥業(yè)未來發(fā)展將產(chǎn)生深遠而廣泛的影響和啟示。在創(chuàng)新藥物研發(fā)方面,量子計算可以大大提高藥物設計的效率和精度,從而加速創(chuàng)新藥物研發(fā)的進程,降低藥物開發(fā)的風險和成本,提高藥物質(zhì)量和安全性。這將為人類健康帶來新的希望和福祉,尤其是對于一些難治性疾病、罕見病、新型病毒等領域。

  而對于制藥業(yè)轉(zhuǎn)型升級來說,量子計算可以為制藥業(yè)提供新的技術驅(qū)動力和競爭優(yōu)勢,促進制藥業(yè)轉(zhuǎn)型升級,實現(xiàn)從傳統(tǒng)制造型向智能創(chuàng)新型的跨越。這將要求制藥企業(yè)加強對量子計算技術的關注和投入,培養(yǎng)和引進量子計算人才,建立和完善量子計算基礎設施和生態(tài)系統(tǒng),與量子計算技術提供商建立緊密的合作關系。

  此外,對于無法忽視的制藥業(yè)監(jiān)管和倫理,量子計算也會給制藥業(yè)帶來新的挑戰(zhàn)和風險,例如數(shù)據(jù)安全、知識產(chǎn)權、社會責任等方面。這將要求制藥業(yè)加強對量子計算的監(jiān)管和倫理,制定和遵守相關的法律法規(guī)、標準規(guī)范、道德準則等,保護和尊重個人隱私、公共利益、人類尊嚴等。

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